生物安全柜和超凈工作臺的區(qū)別如下：
      生物安全柜是為操作原代培養(yǎng)物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護操作者本人、實驗室環(huán)境以及實驗材料，使其避免暴露于上述操作過程中可能產(chǎn)生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的。
      WHO《實驗室生物安全手冊》提出，生物安全柜可以有效減少由于氣溶膠暴露所造成的實驗室感染以及培養(yǎng)物交叉污染。生物安全柜同時也能保護工作環(huán)境。
事實上，生物安全柜更側重于保護操作人員和環(huán)境，防止操作的病原微生物擴散造成人員傷害和環(huán)境污染。
      根據(jù)生物安全防護水平的差異，生物安全柜可分為一級、二級和三級三種類型。一級生物安全柜可保護工作人員和環(huán)境而不保護樣品。其氣流原理和實驗室通風櫥基本相同，不同之處在于排氣口安裝有HEPA過濾器，將外排氣流過濾進而防止微生物氣溶膠擴散造成污染。一級生物安全柜本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流，由于不能保護柜內產(chǎn)品，目前已較少使用。
      二級生物安全柜是目前應用為廣泛的柜型。按照《中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY0569-2005生物安全柜》中的規(guī)定，二級生物安全柜依照入口氣流風速、排氣方式和循環(huán)方式可分為4個級別：A1型，A2型，B1型和B2型。所有的二級生物安全柜都可提供工作人員、環(huán)境和產(chǎn)品的保護。
      超凈工作臺的優(yōu)點是操作方便自如，比較舒適，工作效率高，預備時間短，基本上可隨時使用。這是一種供單人操作的通用型局部凈化設備，氣流形式為垂直層流與水平層流，它可造就局部高清潔度空氣環(huán)境，是科研制藥、醫(yī)療衛(wèi)生、電子光學儀器等行業(yè)為理想的專用設備。
      在工廠化生產(chǎn)中，接種工作量很大，需要經(jīng)常長久地工作時，超凈臺是很理想的設備。超凈臺由三相電機作鼓風動力，功率145～260W左右，將空氣通過由特制的微孔泡沫塑料片層疊合組成的“超級濾清器"后吹送出來，形成連續(xù)不斷的無塵無菌的超凈空氣層流，即所謂“的特殊空氣"，它除去了大于0.3μm的塵埃、真菌和細菌孢子等等。超凈空氣的流速為24～30m/min，這已足夠防止附近空氣可能襲擾而引起的污染，這樣的流速也不會妨礙采用酒精燈或本生燈對器械等的灼燒消毒。工作人員就在這樣的無菌條件下操作，保持無菌材料在轉移接種過程中不受污染。但是萬一操作中途遇到停電，暴露在未過濾空氣中的材料便難以幸免污染。這時應迅速結束工作，并在瓶上作出記號，內中的材料如處于增殖階段，則以后不再用作增殖而轉入生根培養(yǎng)。如為一般性生產(chǎn)材料，因其豐富也可棄去。如處于生根過程，則可留待以后種植用。
生物安全柜是一種在微生物學、生物醫(yī)學、基因重組、動物實驗、生物制品等領域的科研、教學、臨床檢驗和生產(chǎn)中廣泛使用的安全設備，也是實驗室生物安全中一級別防護屏障基本的安全防護設備。
生物安全柜與超凈工作臺這兩種設備常容易被混淆，其實兩者之間是有本質區(qū)別的。
具體的生物安全柜和超凈工作臺的區(qū)別如下：
1. 生物安全柜是一種在生物醫(yī)學、微生物學、生物制品等等一些領域的實驗、檢驗、科研、教育以及在生產(chǎn)過程中應用到的安全潔凈設備，同時也是實驗室內生物安全中一級防護屏幕中基礎的安全防護設備。
2. 生物安全柜是屬于一種負壓的凈化工作臺，是生物安全隔離設備，使工作人員以及工作環(huán)境免受生物細菌的危害，能夠保護操作人員的生命安全以及工作環(huán)境的安全。而超凈工作臺所保護的不是工作人員以及工作環(huán)境而是操作對象，所以在微生物學、生物醫(yī)學等領域的科研、教學、生產(chǎn)中，所使用的是生物安全柜而不是超凈工作臺。
3. 超凈工作臺作為保護實驗室材料而設計的，通過風機把空氣吸進預過濾器，通過靜壓箱進入高效顧慮器進行過濾，把過濾后的空氣以垂直或者是水平氣流的狀態(tài)送出，使得操作區(qū)域能夠達到百級潔凈度，以保證工作區(qū)域的潔凈度要求，只是能夠保護樣品不能夠保護人員。
4. 從潔凈度上來說，生物安全柜要比超凈工作臺要高。超凈工作臺的優(yōu)點在于操作比較簡單。